“只属于自己的宝物”究竟是什么呢？故事的舞台位于帕一只狗和一只猫在沙漠里流浪着，它们的肚子都很饿，正无力地前行，忽然发现前面地上有一饭盒，它们迫不及待上前打开，里面出来个神仙，说可以帮它们每个完成一个愿望，猫急切地说，我要鱼，我想吃鱼…呼一声它们面前出现一条又大又飘香的鱼，神仙接着问狗想要什么。狗皱了皱眉头说，我比较喜欢吃骨头，帮我把鱼变成鱼骨。呼一声后，猫两眼发直地看着狗在吃着鱼骨…底亚地区，那里有着多彩的自然，人与宝可梦生活在一起。“我想请你们为新生和转学生制作一段影片，传达学院的美好之处。”某天，有3位学生如此受到了学院校长克拉韦尔的拜托。他们分别是擅长吹奏长笛，但想要逃离演奏会带来的压力，性格内敛的小原；非常喜欢宝可梦对战，一心想要打败妮莫，性格固执的艾力奇斯；以及过分执着于寻找独家新闻而总给他人添麻烦，性格天真的荷马。自顾不暇的他们多少有些磨合不来。然而，随着和宝可梦一起成长，3人的步调逐渐变得统一……